モアレというのは300dpiなどの解像度落としてスキャンした時に生じる縞々ムラ
600dpiスキャン時に見える網目模様は網点と言ってモアレとは別物
モアレ除去をかけても効果は薄い‥というか単にボカシてるだけっぽいので
フォトショ使う予定があるならそっちでガウスぼかし＋NeatImage かけてやるほうがいい

ただしキヤノンのスキャナ使ってるなら粒状感低減は強にしたほうがいいかも
その辺のことは自炊wiki説明書の項にある ピンナップ自炊プロセス が詳しい