先ほど、再検証しようと思ってコントロールパネルからデバイスとプリンターを選んでMD-5500からプリンターのプロパティを開き
詳細設定タブから新しいドライバー(W)をクリックしてプリンタードライバーの追加ヴィザードを始めて、
MD-5500Pを指定し直してDRVW2KフォルダのAL1Cを(一つだけ表示される)選んでクリックして追加ヴィザードを終わらせると

今までの異常がほとんどなくなってきれいに印刷されました。

ほとんどですからまだおかしな点は残っています。