>>256
> 仰るとおり紙送りムラが疑わしいですね。転送の関係からか読み取り中に一旦
> 停止することがあるので、それによる影響なのかもと思っています。

それ、ドライバの設定で防ぐことができるよ。
スキャンするときに出てくる「Canon DR-2501C … の設定」のウィンドウで、
「スキャンオプション」を「先読みスキャン」じゃなくて「標準」にすればいいだけ。
そうすればページの読み取りの途中で一時停止することはなくなるよ。