その用途だと、初めにレンタルでfi6140あたりを借りて厚い本は全部片付けちゃって
残りはフラットベットを買って一枚ずつってのが良いんじゃないだろうか?
ADF機はどうしてもゆがみとか出るから、少しでも認識率を上げるために
フラットベット機で精密にスキャンした方が良いと思う

手間を惜しまないなら、ADF機買って全部見直し修正掛けるって方法もあるけどね