初心者で自炊を始めたものです。
データの保存の形式についてアドバイスをいただけないでしょうか？

スキャナー：　ScanSnap　S1500
保存物：　自費出版の論文など図書館にない論文や収集データ
必要クオリティ：　文字を読めればOKなレベル。数式や詳細図はなし。
目的：　常時参照する必要はないが、後年見返したい情報を保存したいので
10年後、20年後にもあけることが出来る形式で保存したい。

現在試験的にやっている論文の自炊版は、
S1500 でPDFで取り込んで、アクロバットで検索可能な形式にして保存しています。
スレを見ているとJPEGで保存、閲覧されている人もいるように見うけますが、
JEPGだとOrganizerで1枚1枚バラにしか保存されず、
フォルダでまとめて保存する形式になります。

上記の目的ですとPDFのみで保存がいいのでしょうか？
それとも、別にJPEGでも保存をしておいたほうが安全だったり、
後年便利だったりするのでしょうか？

また、JPEGで保存する場合はバラページをフォルダで保存する以外に
何かいい方法があるのでしょうか？

どなたかアドバイスいただければ助かります。