ちょっと疑問に思ったんだけど・・・

互換カートリッジや詰替えインクを使ってて故障した場合に
メーカー修理に出したら扱いが変わったりするのかな？

無料保証期間が無効になるのはしょうがないけど
他に何か不利が生じるようなことはあるんでしょうか？