機種やどういう手順でやっているか書いた方がいいよ
カラーJPG、カラーPDFで両面設定でメモリデバイスかスキャンToフォルダか
ToPCのような手順（本体からなら）、PCからならそれに順ずる手順で
いいハズだけど？　何か間違ってるんじゃないの？