>縦罫線が左右に揺らいでスキャンされたりする原稿はない？（特に横目の紙）
一応確認のためにシステム手帳を読み込んでみました。
どうでしょうか？『＋雑誌スキャンの見本入れてみました。』

http://ud.vg/02biz
dlパス：ADF見本

>・64bitOSへの対応は？（公式サイトに情報ない感じ）
説明書にもありません
実際、32ビット互換モード等でやってみないとわかりませんね…

>・作動音はS500と同程度？
>・S500で時々ある「原稿サイズ不明なので最大で読んだぜ」みたいなのはない？
S500に比べたら静かです。
自動サイズ検知指定は50枚程度やって、今のところ無いです。
(ほかは、すべてサイズ指定で、すべてそのサイズで読み取りされてます)

>ファイリングソフト
　使って無いから分からないです。レポは他の方に譲ります。