>ICCプロファイルで色調整ってできるのでしょうか?
色調整は出来ないっぽい。調整できるのは、
『明るさ・コントラスト・ガンマ』ぐらい

誤動作発見
 黒ベタが多いページで、
  ・『自動切抜き』をVチェックすると黒ベタのところが切られる
  ・『自動傾き補正』をVチェックすると画像が傾く
 ⇒対策 これらをOFFすると問題なくスキャンされる