>その書類の決まったある一部分だけをOCRする事は可能なのでしょうか？

fi-5120cのTwainでなら、読み取れる領域を制限できるよ。
例えば、書類のサイズそれ自体はA4だったとしても、
「左端Xmmから内側だけ読む」「右端からYmmはカット」「上方Ymmはカットしてその下だけ読む」とかすれば、
住所のラベルを貼った領域だけ読ませることは可能ですね。

OCRの精度は使うソフトによると思われますが、「やさしくデジタルファイリング」（←またかってｗ）でなら、
そこそこ認識してくれますね。