Acrobatならちっとも難しくないぞ。
目的のファイルを開く→「名前を付けて保存」→ファイル形式でJpegを選択
でファイルの全ページをJpeg化できる。
再度AcrobatでPDFにし直すのもよし。再度OCRソフトに読み込ませてもよし。

バッチシーケンス使えばもっとスマートに出来るかもしれん。