キヤノンの960iと860iではインクの数が違いますが
これはランニングコストに多大な影響を及ぼすものなのでしょうか？

あまり価格差はないのでその影響を上回る性能差ならば
良い物をチョイスしようと思っているのですが…

写真、普通印刷は大体3:7程度です