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低解像度で読み込みから細部がボケボケになるんでしょーが、紅ショーガ。
漏れなら

　１）高画質モード（JPGの圧縮設定は1）で左脇からややえぐりこむように一気にスキャン。

　２）PDF内のJPGを一括ブッコ抜き。全部同じフォルダに
　　　（１でカラースキャンのJPG出力にしとけばやらなくてもいい）

　３）藤（ttp://www.vector.co.jp/soft/win95/art/se132646.html）を使って
　　　白黒化＆リサイズ（TIFFは無理だが、望むならPNGへの変換も化）
　　　を実施。JPGの画質もここで変更。

藤なら出力設定さえしておけば後はフォルダごとドラック＆ドロップで一括変換
だから楽チン。
このやり方がお気に召さないとか、どうしてもプログラムを作ってやりたいんじゃ〜
とかいうなら、最早俺から言う事は何も無いが出来るかどうか分からない方法を
探ってる時間で作業が終わると思う。