ScanSnapとやさしくファイリングを直接連携させるソフトが出たようだ。
直納☆やさしくファイリング　http://www.cs4u.co.jp/

ScanSnapの出力データを直接Tiffへ変換するらしい。
てことは他のOCRソフトでも使えないかな？PDFのOCRには色々難点があるからね。
もっとも、読んでココは他のソフトで作ったTIFFを読めないことがあったが…