まあ普通に考えてプロセスが終了すればコネクションも切れる。
CGIはリクエスト毎にプロセスが終了するので、誰かが生き続けないといけない。
PHPの場合は mod_php が apache 内部で生き続ける。
同じことを perl でやろうとするなら、当然 mod_perl という話になる。