Bootstrapはよく知らないけどようはCSSでしょ？
そもそもCSSってのは文書構造と見た目を分離するものなんだからさ、

まず、Bootstrapを使っているHTMLから
全てのCSSを取り除いても、文書自体はちゃんと見れるはずだよね。

その上で、Bootstrapの代わりに独自のCSSを
読みこめばいいだけじゃない？

昔はそうやってブラウザの機能やJavaScriptを使って
適用するスタイルシートを切り替えることで
同じページの見た目をがらっと変えるってことが
流行ったんだけどな。代替スタイルシートって機能。