今会社で５人ぐらいでRailsアプリを開発してるけど、特に困ったことは無いな。
ＤＢ変更する時は突然マイグレーションファイルアップするのではなく、口頭でメンバーに伝えて情報共有する。
既存のマイグレーションファイルはいじらない。
rollbackでちゃんと元に戻るように記述しておく。
このぐらいを気をつけていれば何も問題ない。