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PHPとJavascriptは別物。
ウェブシステムをPHPで作る場合、
・ 画面のフォームに入力して送信ボタンを押してサーバから結果を返せばいい場合、Javascriptは不要
・ googlemapの様にマウスの動きで画面が変わるような場合、Javascriptは必要
・ フォーム入力で、他の入力を元にプルダウンメニューの中身等を変える場合、Javascriptは必要