> foreach($value as $val) {
> $encode_val = mb_convert_encoding($value,"EUC-JP","Shift_JIS");

2行目の $value は $val のタイポ？
あとmb_conv...()は配列なんか受け付けないよ

foreach ($value as $val) {
　$encode_val = array();
　　foreach ($val as $vah) {
　　　$encode_val[] = mb_conv...($vah, ...
　　　sqlite_query( ...
　}
}