>>199
> 書き込み部ソース：http://source.is.land.to/s/q.phps
これだけ見るとファイルに書き込んでる部分がないので原因は分からない。
なので、allの方だけ見てみるけど、
まず
> $read_1 = file($res_num_dat);//まず、読み込みます。
で読み込んだ直後に、$read_1の内容をvar_dump()して中身を確認。
それが確認できたら、
> $end_1 = end($read_1);//最後の要素を取り出します
の$end_1
> $next_lines = explode("\t",$end_1);//それを分割して配列にしまいます
の$next_lines
> $for_num_lines = array_splice($next_lines,-5,1);//最後から5番目の要素(最後の$num)をとりだします。
の$for_num_lines
> $num = ($for_num_lines[0] + 1);//それに1をプラスします
の$num
をそれぞれvar_dump()して、期待してる動作をしているのか確認する。

それがデバッグの基本。