WebConfigに記述してForm認証でwebアプリ走らせてるのですが、
同じフォルダにwebサービスを作ってそれを叩きたい場合、
クライアントアプリケーションからはどのように認証すればいいでしょうか？

認証フォームで.asmxからのリダイレクトの場合のみ認証をスルーして
適当なユーザーとして.asmxにRedirectさせてみても、
認証フォームに行った時点でクライアントアプリケーションはエラーになってしまいます。