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startTimeは権限に関係なくcommon.phpで実行されてる。
後は表示寸前に時計を止める。
$xoopsTpl->assign('dumpTime', $xoopsLogger->dumpTime());
footer.phpの$xoopsTpl->display()の直前にでも書いとけ。
そっから先は自分で考えろ。