php は cgi として動かすこともできますが
普通は apache などの web サーバの
ネイティブのモジュールインターフェースを介して
動作します。
設定にもよりますが、 .php という拡張子をつけ
<? ?> で囲んだ内側が php の文法に則っていれば
# /usr/bin/php などとつけなくても
正しく動作します。