画像ディレクトリ数は一つでなく枚数で切り分けていったほうがレスポンス的にいいですよね？
どれぐらいの基準が妥当なんでしょうか？

1ファイル平均20kと考えて、1ディレクトリ1000枚ってどうでしょう？