>>678
fork して入出力 (STDIN/OUT/ERR) を閉じれ。
完了確認はメール送るなりなんなりすれ。
http://www.google.co.jp/search?q=CGI+%E3%82%BF%E3%82%A4%E3%83%A0%E3%82%A2%E3%82%A6%E3%83%88

>>680
Perl の場合は NFS 越しの flock は意味を成さないのと、
flock を実装していない OS に対応する為に、排他処理を
自作ルーチンでやる事がある。これらに当てはまらない
環境で使う事が分かっているなら flock が無難。

…という話は散々既出で嫌がられるので、以後はこの辺に。
http://pc2.2ch.net/test/read.cgi/php/1024795138/