レスありがとうございます。

>492
アクセスログを見たところ、%A0になってしまっていたのはいずれもUAがMac_PowerPCの方でした。
確認できた件数が6件と少ない為に断言はできませんが、Macからの送信で化ける可能性が高いと判断したのですがいかがでしょう?
自分ではMacマシンを所有していないので、正確な調査が行なえず申し訳ありません。

試行錯誤の末、>487のリンク先や、Perlメモの記述を参考に、1文字ずつ見ていくような処理が行なえるようになりました。
これでしばらく様子を見ようかと思います。
別の文字コードで試すというのは、「別文字コードでの送信」という意味でしょうか?
後程、やり方を調べた上で試してみたいと思います。

>493
accept-charasetは知りませんでした。
早速試してみたいと思います。