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レスありがとうございます。やっと意味がわかりました。

つまり、例えば2.のデータファイルはeucコードなのに、
3.でS-JISとして表示していないか、ということなのですね。

お恥ずかしい話なのですが、
無料サーバなので、telnetが使えないのです。

環境を再現する方向で、なんとか対応してみたいと思います。
こんな夜中にありがとうございました。