>>365
> どの拡張子がＣＧＩスクリプトとして実行すると決めておくのがサーバー設定ってことですか？

そう

> ＷＥＢサーバーを通さないってことはＦＴＰでってことですか？

別に何でもいい。FTPじゃ無理だと思うが。
たとえばis○ebのようにセキュリティの甘いところはCGIスクリプトを使って他人のファイルを覗ける