知識欲からパフォーマンスチューニングについて質問です(素人、勉強中です)。

例えば2ちゃんねるみたいな大量アクセスがあり、頻繁に書き込みがある
スレッドと、そうではなく過疎化しているスレッドからなる掲示板があって、
1つのテーブルでユニークID、板ID、スレッドID、記事ID・・・のように
管理するとします。細かい話をしだすとキリが無いので、なんとなく一般的に
ベストなインデックスがついているとします。この場合、メモリ管理はどのへんの
設定を変えるとパフォーマンスに一番効果があるでしょうか?query_cache_sizeでしょうか?

ちなみにあくまでMYSQLの知識欲を満たしたいので、HTML化しろとかは無しで。