教えてください。
MySQL＋PHP4.Xで開発をしているのですが

ある不特定のユーザーが登録済みのデータや画像ファイルを変更しようとすると
登録してあるデータおよび画像ファイルが消えてしまう現象が起きました。
消えない場合もありました。

PHPのソースを追いかけても削除しているロジックがありません

内部で再現テストをしてもまったく起きる気配がありません。。。
しかし、ユーザーから「データが消えた」とクレームがいまだ来たりしています。

一般向けに公開しているサイトであるため複数アクセスはあるので
トランザクションの問題かと思ったりもしたのですが
テスト上ではこういう現象はやはり起きませんでした

MySQLの設定でこういう問題は回避できるのでしょうか？
それともユーザーの回線が細いとこういう現象がおきやすいのでしょうか？

OSはRedHat7Jです