多分>>124の人が見た動画の作者ですが・・・

VirtualDubは本家と別の作者によって
多機能な派生版が作られてます。
「VirtualDub-MPEG2」と「VirtualDubMod」というのがあって、
これらは本家とは別になります。
VirtualDubModは日本語化されてるんでそちらを
使ってみてはどうでしょうか？

合成の詳しい手順についてはマニュアルを
読んでもらうしかないんですが
基本的な考え方だけ簡単に説明すると、
VirtualDubは元の動画に「フィルタ」を重ねて
合成していくソフトです。
フィルタには、動画の一部分のみを拡大するとか、
色を変えるとか、上下反転するとか様々な種類があって、
字幕は「TextSub」という一種のフィルタになります。

あと、VirtualDubを使って合成しなくても
カラオケOFF等で使うだけなら、
字幕ファイル(.ass)さえ作れば
対応するプレーヤーで読み込んで使えます。
VirtualDubで合成しているのは
ニコニコにアップして使ってもらう為なので・・・