京都アニメーションのサイトにて
「山本寛は監督としての域に達していないため降板、第５話より新監督のもとで製作」する旨発表がありました。

http://www.kyotoanimation.co.jp/info.html

ＯＰの「怪物クン」を始め、自社が関わっている『ハルヒ』『フルメタﾌふもっふ』『Kanon』などのネタを多用し、本来あるべきほんわかした『らき☆すた』ワールドを殺いでいることにたいしての苦言があったせいかも知れません。
自分としても、あまりに『ハルヒ』ネタが多く感じられ、またこのことが一部の「アンチハルヒ」派にとっては苦々しく写ったのかも知れません。
　今後、ＯＰ出だしの声の差し替え、ＥＤ変更なども予想されます。
ダンスシーンも少なからず影響を受けるかも知れませんね、、、。