郵便振替で専用口座を作るのはどうですか？
団体名で口座作れますし、郵便局から振込の通知が郵送されますし、
募金する方も匿名で出来ますし。
口座開設から1週間でネットからも募金状況確認できますよ。
受領書は連番なので、1枚でも抜けていたらすぐに分かります。

今まで個人の口座に入ってしまったものはどうするか分からないのですが。
領収書もデジカメで撮るなりスキャンするなりして全部うｐしないと
納得して貰えないのでは？