どこの団体でも物資よりは金銭を喜びますよ。
物資を受け入れないNPOが殆どだと思います。

他で同じような活動をしているところから得た情報ですが、
>>657さんがいわれているように
大使館が受け取った物資に関して、空港までの手配をするだけのようです。
日本からパキスタンまではパキスタン航空が空いたスペースに物資を詰めて
無料で運ぶらしいですよ。
その後は軍が被災地まで運ぶということになっているようです。

金銭で送るというのも手段の一つではありますが、
現地付近では物資の調達が難しくなっているという情報もありますので、
受入先の大使館とちゃんとした連絡を取って、物資を送るというのもひとつの
選択ではないでしょうか。