東北仙台offのスレで、１０００羽のまとめかた書き込まれていたので
コピペします。参考にしてください。
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どうも。何故か「繋ぎマスター」として認定されてしまった仙台31でつ。
漏れが使っている1000羽にするためのつなぎ方は↓。うまく説明できません・・・。

①まず、糸鶴（藁）たちを何本か（タコ糸など、太いものならば６～７本・
テグスあるいは普通の裁縫用の糸など、細いものならば８～１０本）を、
手に取ります。そのとき、持つところは各鶴糸の根元を持ちます。
　｜　　｜　　　　　　　　　②そのまとまった数本の根元をしっかり持った
　｜　　｜　　　　　　　　　状態で、下部の鶴の状態を見てください。
　｜　　｜←ここいらへん　　一番下の各鶴が綺麗にそろわないと、最終的に見た目が
　○　　○　　　　　　　　　美しくならないので、各々の鶴糸の長さを、糸を引っ張ったり
（鶴）（鶴）　　　　　　　　弱めたりして長さを調節してください。
（鶴）（鶴）　　　　　　　　　　　　　　　　　↓
（鶴）（鶴）　　　　　　　　どうしてもそろわない！！というときは、
（鶴）（鶴）←ここを揃える　鶴糸が綺麗に完成していない状態です。
（鶴）　｜　　　　　　　　　鶴を繋げるとき、鶴の背中とお尻がうまく
（鶴）（鶴）　　　　　　　　組まれていないのです。
（鶴）　｜←このように、鶴糸の鶴がきちんとつまっていないのが原因
　　　（鶴）これだと、どんなに揃えても長くなります。

ですから、作業に入る前に、一度鶴糸を見て、鶴が綺麗につまっているか
どうかを確認してからこの作業を始めてください。