>個人的には、TCP/IPのプロトコルスタックのオーバーヘッドのほうがドミナントかと予想する。

NetperfってIP以外のプロトコル使えるはずだよ
少なくともTCPまでは上ってないのは間違いない

32bitバスが一番ボトルネックでしょ