自動アップデートの件ですが話の中ではスペイン本部がやっているとのことだった気がします。
ただ曖昧なのでもう一度確認したいと思います。

公開質問状は英訳してスペイン本部にも送りたいと考えていますが届くかどうかは現段階では不明です。
ただFonジャパンはこの件の窓口は日本ですと言っていたのでFonジャパンで問題ないとも思いますが。
あとFonジャパンの所在地や代表者氏名等も公開していただいていますがそこから判断するにFonジャパンで大丈夫だと思います。

カスタムファームについては改悪というか当然の結果ではと思いますが少なくとも今回の件とは別問題たど考えています。
Fonジャパンの担当者も今回の件を一応は上申という形であげているようですので期待できないの判断はもう少し待つべきかと。