>>423です
物理ポートにはswitchport mode accessコマンド実行して
port-channelにはswitchport mode trunkしたらどうなるのって質問です。
機種はCatalyst2960を想定で

Switch(config)#interface range fastethernet 0/1 - 2
Switch(config-if-range)#switchport mode access
Switch(config-if-range)#channel-group 3 mode on
Switch(config-if-range)#exit

Switch(config)#interface port-channel 3
Switch(config-if)#switchport mode trunk