>>744 さん連投です。

こちらのIXでフラグメント処理が起きてたんで
サーバのeth0のMTUをフラグメント起きない値ギリギリまで下げ
IXに投げるようにしたらダウンロード速度が約2倍になりました。

sh ipv6(またはip) traffic の 
IP statistics: の
Rcvd: reasm oks が復合化
sent frag oks, が分割化の処理量なると思います。

もし、>>744さんのIXでフラグメント処理が大量に行われているのであれば、
改善させることで劇的に速度があがると思います。
個人的にはこんなに変わるとは思ってなかったw