RT RTXシリーズで ipip トンネルの場合フィルタって関係しましたっけ?
なんか、過去にフィルタがあっても、すんなりつながった記憶が・・・・
Yamahaのサイトで見てもフィルタがないか、相手側WAN側アドレスからの通信をとおす単純な
フィルタを設定している例しかなかったです。
http://netvolante.jp/solution/flets/term1_57.html (フィルタなし)

認証もセッションもなにもないipipトンネルでお互いトンネルの終端を tunnel endpoint address
で指定するだけで通信できるようになるとすると怖い気がしますね。