VPN経由で数拠点のユーザーが
ファイル鯖にアクセスするのですが
鯖本体に掛かる負荷は、LAN経由もWAN経由も同じなのでしょうか？

回線がネックになるのでLANほどシビアに考えないでOKなのでしょうか？