まぁ特許持込で成功した日本人って
かつてIBMにフロッピィディスクを持込したドクター中松氏ぐらいしか知らんなｗ

プロトコルは様々なプロトコルが既にあるよ。
日本人も結構頑張っていたりする。
Jxta-JPのkamipu氏とかな。
大抵はNATを超えられないから使えないけどなｗ

制御用の独自プロトコルも幾つかあるけれど、
それらはcisco独占というかcisco機器専用ってのが多いしな。
例えばHSRP(仮想IPプロトコル)やEIGRP(最速ルーティングプロトコル)
とかはcisco機器専用。

ぶっちゃけTCP/IPは古い規格だし、無駄も多い。
JxtaやGrooveのようなTCP/IPの5倍速の通信規格もある。
が、世の中の通信機器がIPで最適化されている。準拠されている。
これを崩すのが難しい。