真面目に調べたけど、Cat3550なら、CPUが生成するパケットは、

COS 7
DSCP 48

にマーキングされる。

キュー4に入るから、その他のトラフィックを入力IFでマーキングして、
キュー1〜3にぶち込めば、SNMPTrapは救われる。

嘘だと思うなら、Cat3550にWRRの設定して、装置自身からPing打って、

sh mls qos interface statistcis

でどのキューのカウンタが上がるかみてみればいいよ。
ただ上のコマンドはcat3750でしかやったことないから、cat3550みたいな古いので入るか知らんけど。