上記の件、多少解決しました。

BINDさせていない事が原因のようでした。
set vpn "vpn" id 2 bind interface tunnel.1

これでOSPFは動くようになったのですが
tunnel.1がready状態からupに変わってその後数分したらすぐDown状態になってしまって
電源をON/OFFしないと復旧しません。
これは何か設定の変更が必要なのでしょうか？

それとNetscreen側でOSPFの情報は受け取るのですが
Netscreenのtrust側の情報をVPNの対向先(yamahaルータ)に伝えていないようです。

対向先のyamahaルータでネイバーを確認すると
ネイバーのアドレスがnetscreenのグローバルアドレスになっているのもおかしい点なのかなと感じています。
（netscreenからyamahaルータのプライベートアドレスにtracerouteをすると
　tunnelがUP状態だと、netscreen以降が全て*になり、down状態だとインターネット側へと向かってしまいます。）

説明不足な点が多いかと思いますが
何かしらアドバイス頂けたらと思いますので
よろしくお願いいたします。