「ゼミ」は、ドイツ語読みのゼミナールで、卒論、修論、博論対象。
「セミナー」は英語読みで、準講演会的な広いものから「ゼミ」に近い狭いものまである。

もともと同じ言葉だが、実際には使い分けられている予感ｗ