原文や元の和訳文の詳しい文脈は知らないが、
>「もし（学生が）指導員，おそらく博識で有能で恥知らずな牧師，
>のいうことを信じなかったとすれば，その疑いは非合理的であり，
>論拠を評価する能力の不足を，彼が耕していると思われている
>科学の分野での成功への致命的な欠陥を示すものである．」
という部分だけを、その文脈に従って和訳すると
>「もし（学生が）指導員，おそらく博識で有能で清い心の持ち主である牧師，
>のいうことを信じなかったのなら，その不信感を何故持ったのか私には理解出来ず，
>実験証拠を評価する能力のなさが，彼が研究していたと思われる
>科学の分野での成功が認められなかった致命的な原因となるものである．」
のようになるんじゃないか。
これでもしっくりせず、ダメだろうが。