【R言語】統計解析フリーソフトＲ 第４章【GNU R】
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0001１３２人目の素数さん
2011/01/09(日) 17:31:49統計計算で重宝するデータ型や、複数要素を処理する演算や関数、
解析結果を表示するグラフィックなど、多彩な機能を提供します。
●関連サイト
The R Project
http://www.r-project.org/
RjpWiki
http://www.okada.jp.org/RWiki/
リンク集
http://www.okada.jp.org/RWiki/?%A5%EA%A5%F3%A5%AF%BD%B8
0552551
2012/06/04(月) 19:07:14.04> unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target, value=TRUE))))
[1] "abaa" "abef" "aefe"
0553542
2012/06/04(月) 19:39:49.43あとは、target内の要素の順序を保つようにならないものかな。
0554542
2012/06/04(月) 19:47:57.32pattern <- c("ab","ef"); target <- c("abaa","abef","aefe","cafe","abef")
target[sort(unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target)))))]
0555１３２人目の素数さん
2012/06/04(月) 19:49:05.43あぁ、そうだね。
わざわざ1:lenght(pattern)でやるより、簡潔にsapply(pattern, function(x) ...)でよかった。
ご指摘ありがとう。
> target <- apply(matrix(sample(letters[1:6], 4 * 10000, replace = TRUE), ncol = 4), 1, paste, collapse = '')
> pattern <- c("ab","ef")
> system.time(target[unique(unlist(sapply(1:length(pattern), function(i){grep(pattern[i], target)})))])
ユーザ システム 経過
0.004 0.000 0.005
> system.time(unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target, value=TRUE)))))
ユーザ システム 経過
0.004 0.000 0.007
速度的にはあまり変わらないみたいだが。
0556542
2012/06/04(月) 21:20:11.29target[sort(unique(unlist(sapply(pattern, function(x) grep(x, target)))))]
あと、greplを使えないかなと思い、>>555 氏の方法でランダム生成した
サイズ 10000 の target に対し、
target[apply(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target)),1,any)]
を適用してみましたが、apply系の関数を2重に使うと、当たり前ですが
遅くなりますね。
> pattern <- c("ab","ef")
> target <- apply(matrix(sample(letters[1:6], 4 * 10000, replace = TRUE), ncol = 4), 1, paste, collapse = '')
> system.time(target[unique(unlist(sapply(1:length(pattern), function(i){grep(pattern[i], target)})))])
user system elapsed
0.01 0.00 0.02
> system.time(target[sort(unique(unlist(sapply(pattern, function(x) grep(x, target)))))])
user system elapsed
0.02 0.00 0.02
> system.time(target[apply(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target)),1,any)])
user system elapsed
0.05 0.00 0.05
0557542
2012/06/04(月) 21:46:39.76rowSums のほうが、だいぶ速いんだね。知らなかったよ。
> system.time(target[apply(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target)),1,any)])
user system elapsed
0.05 0.00 0.05
> system.time(target[as.logical(rowSums(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target))))])
user system elapsed
0.01 0.00 0.02
0558１３２人目の素数さん
2012/06/04(月) 21:52:36.36投稿しようとしたら書かれてた
rowSumsはCで書かれてるはず
lapplyも同様
sapplyはlapplyを呼んでいる
applyはRで書かれていて遅い
0560１３２人目の素数さん
2012/06/04(月) 23:15:00.88, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
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| l＾,人| ` `-' ゝ | さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
| ` -'＼ ｰ' 人 一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
| /(l ＿＿／ ヽ、 良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
| （:::::`‐-､__ |::::`､ ﾋﾆﾆヽ、 あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
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0561１３２人目の素数さん
2012/06/05(火) 07:03:58.00プログラムを実行する手段はありますでしょうか。
（Fortranの実行ファイルみたいなイメージです）
0562１３２人目の素数さん
2012/06/05(火) 07:09:23.62, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
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0563１３２人目の素数さん
2012/06/05(火) 15:37:11.75RにはSASで言うところのマクロみたいな物はないでしょうか？
0564１３２人目の素数さん
2012/06/05(火) 20:30:53.61, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
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0565１３２人目の素数さん
2012/06/05(火) 22:40:37.650566１３２人目の素数さん
2012/06/06(水) 00:22:27.48, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
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0567１３２人目の素数さん
2012/06/07(木) 09:54:47.13>>561
?compiler::compile
このあたりを入り口に文献を読んでみて。
ところで、R.exeが入ってなくても、R.dllは入れてもいいの？
やりたいことを達成するには、Cなどで書いて、
R.dllが一緒にインストールされるソフトを作成する必要がある気がする。
>>563
SASはほとんど使った経験がないから、回答する資格がないけど、
R言語そのものがRのマクロとも言えます。
お手元のR入門書の「関数化」の項を読んでみてください。
>>565
異なる作者による同じ目的のパッケージだと、そのようなことは起こるかも知れません。
何千もある投稿パッケージの全てにおいて整合性がとれているわけではありません。
再現性が確認できたら、RODBCとXLConnectのメンテナに報告するとよいでしょう。
0568１３２人目の素数さん
2012/06/09(土) 23:34:52.27, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
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0569１３２人目の素数さん
2012/06/10(日) 06:29:56.30, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
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0570１３２人目の素数さん
2012/06/13(水) 20:54:59.86, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
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0571１３２人目の素数さん
2012/06/18(月) 14:21:06.94真摯な回答をする人が何人もいて、偉いな。
0572１３２人目の素数さん
2012/06/22(金) 16:40:13.73Rってプログラミング言語なのでプログラムスレッドに移住するそうですよ。
無理にとは言わないので出来たらお願いしますね。
統計解析R たぶんpart3くらい
http://toro.2ch.net/test/read.cgi/tech/1340339592/
0573１３２人目の素数さん
2012/06/24(日) 14:58:20.27, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
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0574542
2012/06/27(水) 21:28:07.950575１３２人目の素数さん
2012/06/27(水) 22:14:18.48読み込む方法はないかなあ。
cvsに変換して読み込んでいるけど、ちょっとだけメンドイ。
0576１３２人目の素数さん
2012/06/28(木) 13:28:01.62read.ods() from ROpenOffice
ttp://www.omegahat.org/ROpenOffice/
0577１３２人目の素数さん
2012/06/28(木) 16:25:13.46サンクス！
CRAN関連ばかり探していたから引っかからなかった訳だ。
ダウンロードして見たが、CRANじゃないのでインストール方法が判らん。
初心者なんでもうちょっと勉強してみる。
0578１３２人目の素数さん
2012/06/28(木) 16:40:01.10$ sudo R CMD INSTALL Rcompression_0.93-2.tar.gz ROpenOffice_0.4-0.tar.gz
でOK。
Rcompressionがない状態でROpenOfficeをインストールしようとすると、
$ sudo R CMD INSTALL ROpenOffice_0.4-0.tar.gz
* installing to library ‘/usr/local/lib/R/site-library’
ERROR: dependency ‘Rcompression’ is not available for package ‘ROpenOffice’
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/ROpenOffice’
とおこられちゃう。
Windowsで R CMD INSTALLを使う場合は、 別途Windows toolsetが必要らしい。
ttp://cran.r-project.org/doc/manuals/R-admin.html#The-Windows-toolset
0579１３２人目の素数さん
2012/06/28(木) 17:39:04.25重ね重ね丁寧に答えていただき、有難うございます！
0580１３２人目の素数さん
2012/07/02(月) 23:44:45.34, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
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0581575
2012/07/04(水) 19:45:39.22Googleドキュメントのspreadsheetで read.csv("URL") から直接データーを
取り込めることを知り、色々試しているところです。
現時点では、spreadsheetのセル内に日本語使用すると、read.csv 失敗します。
英文字のみであれば、問題なく取り込めています。
バージョンの新しRだど2byte文字処理で不具合出るという話もあったので、
現状では出来るだけ日本語使用しないほうが良いみたいですね。
それから、Google spreadsheet をcsv形式でダウンロードしたファイルは、
Shift-JISにデコードし直さないと read.csv で取り込めませんでした。
UTF-8形式だったから読み込めなかったのかなあ。
まあそれでも Google spreadsheet が使えることが判ったので、
データー入力ツールはこれでいくことにします。
0582１３２人目の素数さん
2012/07/05(木) 09:17:17.75ヘルプぐらい読んでもよいと思うよ。
fileEncoding: character string: if non-empty declares the encoding used
on a file (not a connection) so the character data can be
re-encoded. See the ‘Encoding’ section of the help for
‘file’, the ‘R Data Import/Export Manual’ and ‘Note’.
encoding: encoding to be assumed for input strings. It is used to mark
character strings as known to be in Latin-1 or UTF-8 (see
‘Encoding’): it is not used to re-encode the input, but
allows R to handle encoded strings in their native encoding
(if one of those two). See ‘Value’.
0583575
2012/07/05(木) 19:39:30.67サンクスです！ help読んでなかった・・・・
read.casv("file name", encording="UTF-8")で無事読み込めました。
これでだいぶ助かります。
0584１３２人目の素数さん
2012/07/11(水) 12:33:21.72てっきり高校生か未熟な大学生と思っていたら、
案外おっさんだったw
老けて見えるだけかな。
何にせよ、某所には、公共性の高いものだけに絞って書き込んで、
それ以外は、ここ(2ch)に書き込んで欲しいぞ。
c(letters[1:26])とか、初心者や入門者を混乱させることを目的とした
嫌がらせとしか思えないぞ。
0585１３２人目の素数さん
2012/07/20(金) 12:52:33.55[ NSTask launch... ] といった感じです。
しかし、スクリプトの末尾にq()を付けてもRの実行ファイルが動いたままになります（アクティビティモニタで確認）。
NSTask のterminateを呼び出しても消えてくれません。
どうもこれが悪さをして意図した動作をしてくれ内容です。
対処方法ご存知のかたがいましたらご回答をお願いします。
0586１３２人目の素数さん
2012/07/20(金) 13:15:11.45q()の引数saveを省略すると"ask"になるのでは？
ヘルプには
| The default is to ask in interactive use but may be overridden by
| command-line arguments (which must be supplied in non-interactive
| use).
って書いてある。
つまり、実験せずに書くが、q()と書いても、入力待ちプロンプトで無限ループになってる気がするぞ。
0587１３２人目の素数さん
2012/07/20(金) 13:52:36.69q("no")
とすれば、入力待ちにならないのでは？
0588１３２人目の素数さん
2012/07/20(金) 14:00:19.17q()の引数にnoを追加しましたが、依然挙動不審です。
どうもコマンド引数に < script.r と指定したスクリプトを読み込めない場合があるようです。
なんこれ？ な状況ですが。
最小単位の構成から実験してみます。
0589１３２人目の素数さん
2012/07/20(金) 14:05:39.29いずれにせよ、q("no")やq("yes")は関係ない。
それらがなくても処理は終了する。
$ echo 'a <- 1' > /tmp/tmp.R
$ echo 'print(a)' >> /tmp/tmp.R
$ /Library/Frameworks/R.framework/Resources/R CMD BATCH /tmp/tmp.R out.txt
$ tail -7 out.txt
> a <- 1
> print(a)
[1] 1
>
> proc.time()
ユーザ システム 経過
0.825 0.051 1.074
ちゃんと終了する。
0590589
2012/07/20(金) 14:09:30.38$ ls -l $(which R)
lrwxr-xr-x 1 root wheel 47 4 27 16:45 /usr/bin/R -> /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R
だから、普通に
$ R CMD BATCH スクリプト 結果ファイル
でいいよ。
0591馬鹿を焼く描写 ◆ghclfYsc82
2012/07/22(日) 16:58:54.77★★★学力格差：尊重しろ
★★★能力格差：最大限利用せよ。
東大や京大にだって馬鹿は沢山居てるんだヨ。
学力格差と能力格差を認める理想社会を実現しろや。要するに：
★★★『馬鹿は無意味なので不必要だから、従って無能は静かにせよ。』★★★
っちゅうこっちゃ。低脳が騒ぐのはワシが許さんのや。
ちゃんと読め。
描
0592１３２人目の素数さん
2012/07/26(木) 09:47:52.47xという1×n個の配列があって、
yという行列の要素を
y[i][j] = x[i]+x[j]としたいとき、
y行列を作る文はどのようにしたら良いのでしょうか
0593１３２人目の素数さん
2012/07/26(木) 10:44:18.59> n <- 10
> x <- 1:n + 10
> x
[1] 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
> outer(x, x, "+")
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10]
[1,] 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31
[2,] 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32
[3,] 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33
[4,] 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34
[5,] 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35
[6,] 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36
[7,] 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37
[8,] 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38
[9,] 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39
[10,] 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40
こういうことか？
0594１３２人目の素数さん
2012/07/26(木) 11:55:59.91そうです！
ありがとうございます！
助かりました
0595１３２人目の素数さん
2012/07/26(木) 12:08:58.20助かったのなら何よりなんだけど、
宿題の類だったのなら、確認もせずに教育の邪魔をして教員に申し訳ない。
0596１３２人目の素数さん
2012/08/05(日) 22:25:40.52このデータがどの確率分布か言い当てることはできますか
0597１３２人目の素数さん
2012/08/05(日) 23:48:09.66これまた宿題っぽい。
質問の動機や、動機を得るに至った背景を説明してもらえますか
0598１３２人目の素数さん
2012/08/07(火) 01:02:34.43R触ってみようと思って最初に思い浮かんだのがこれ
なんだけど探しても見つからないもんだからここで聞くことにした
0599１３２人目の素数さん
2012/08/07(火) 04:10:01.29ググると「コルモゴロフ-スミルノフ検定」というのが出てきた。
0600１３２人目の素数さん
2012/08/07(火) 13:49:09.80>>599さんの答えだけだと、初心者はどうしてよいか分からないと思うので助言します。
> RSiteSearch("Kolmogorov-Smirnov")
以上。
0601１３２人目の素数さん
2012/08/08(水) 15:54:24.83コマンド入力中にうっかりよくわからないキー押してしまったみたいでフォントが変わってしまって・・。
0602baka描 ◆ghclfYsc82
2012/08/08(水) 17:29:54.67>14 名前：１３２人目の素数さん ：2012/08/07(火) 17:39:00.96
> >>13
> 旧コテ猫あらため描つまりお前自身の事だろ、増田哲也に限り無く近い人間｡
> 筑波大学で痴漢と言えば増田哲也だから連続性も明らかになってるから
> わざわざ限り無く近い人間なんて呼び方しなくていいんだけどな
>
0603１３２人目の素数さん
2012/08/08(水) 19:18:57.57, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
／ ／:::::; -‐''" `ｰノ
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| |/ / / /| ,ﾊﾉ| /|ﾉﾚ,ﾆ|ﾙ'
| | | / / ﾚ',二､ﾚ′ ,ｨｲ|ﾞ/ 私は只の数ヲタなんかとは付き合わないわ。
. | ＼ ∠イ ,ｲイ| ,`-' | 頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。
| l＾,人| ` `-' ゝ | さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
| ` -'＼ ｰ' 人 一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
| /(l ＿＿／ ヽ、 良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
| （:::::`‐-､__ |::::`､ ﾋﾆﾆヽ、 あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
| ／ `‐-､::::::::::`‐-､::::＼ /,ﾆﾆ､＼ それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら？
| |::::::::::::::::::|` -､:::::::,ﾍ￣|'､ ﾋﾆ二、 ＼
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0604１３２人目の素数さん
2012/08/08(水) 21:07:17.90, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
／ ／:::::; -‐''" `ｰノ
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. | ＼ ∠イ ,ｲイ| ,`-' | 頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。
| l＾,人| ` `-' ゝ | さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
| ` -'＼ ｰ' 人 一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
| /(l ＿＿／ ヽ、 良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
| （:::::`‐-､__ |::::`､ ﾋﾆﾆヽ、 あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
| ／ `‐-､::::::::::`‐-､::::＼ /,ﾆﾆ､＼ それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら？
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0605１３２人目の素数さん
2012/08/12(日) 19:33:37.42Rを使える人が私以外いないので、
Excelで配布しなければなりません。
今は描画前の関数データを張り付けていますが、
縦軸が変わってしまうので、グラフ描画からそのまま出力したいと思っています。
0606１３２人目の素数さん
2012/08/13(月) 09:08:15.60意味が分からない。
> Rで、グラフとして描画されているデータをテキスト出力出来ますか？
Rグラフィックで描画するには、描画するためのデータがあると思うのだけど。
もしそうなら、そのままテキスト出力すればよいと思うが、
そんなことをわざわざ質問するとは思えないから、よく分からない。
テキスト出力とExcelの関連も意味不明。
> a <- data.frame(x=runif(10), y=runif(10))
というデータフレームがあったとして、
> plot(a)
とRグラフィックに描画して、次のようにすればテキスト出力される。
> a
x y
1 0.1401729 0.223354073
2 0.8426009 0.880151101
3 0.2795089 0.002605373
4 0.8179064 0.131089282
5 0.3903741 0.580761547
6 0.1708031 0.793535840
7 0.8964184 0.198217040
8 0.6109237 0.136335747
9 0.7519352 0.367561028
10 0.6382441 0.429468494
0607１３２人目の素数さん
2012/08/13(月) 09:53:15.56なるほど。データフレームにしてしまえばトラブルを解消できそうです。
今まで、xとyを別々に指定するような作業をしていたので気が付きませんでした。
ありがとうございました。
0608１３２人目の素数さん
2012/08/26(日) 09:50:32.98開始日,数
1,5
2,2
3,4
4,8
……
30,5
のような時系列データの信頼区間やピークを求めたいのですが、
解説サイトとかないでしょうか。
0609１３２人目の素数さん
2012/08/27(月) 11:10:35.51ピークを得るためには、当てはめる関数の形が必要でしょう。
あなたの研究対象に対する先験的知識が本質的に必要だと思われます。
例えばポアソン分布に当てはめられるタイプのデータだと次のようになります。
d <- data.frame(x=1:30, y=round((dpois(1:30,10) + runif(30, max = 0.01))*100))
barplot(d$y, names.arg = 1:30)
こんなサンプルデータで、nls()を使って、
m1 <- nls(y ~ (a * (lambda^x*exp(-lambda)/gamma(x+1)) + b),
start = c(a = 1, b = 1, lambda = 10), data = d)
とすると、
> max(predict(m1))
[1] 13.14048
> which.max(predict(m1))
[1] 9
9日目で最大値13のピークになることが分かります。
0610１３２人目の素数さん
2012/09/14(金) 21:05:08.72ggplot2で描画しようとするとメモリオーバーになってしまう
なんかうまい方法はないものか
0611１３２人目の素数さん
2012/09/15(土) 00:15:23.75分割して描画すればどうなる？
ggplot2じゃないけど、例えばこんな風に。
> d <- data.frame(x = runif(100), y = runif(100))
> plot(d[1:25, ], xlim = range(d$x), ylim=range(d$y))
> points(d[26:50, ])
> points(d[51:75, ])
> points(d[76:100, ])
0612１３２人目の素数さん
2012/09/15(土) 09:17:37.47どうもです
確かに仰る通り、::baseのplotならば可能です
後だしですんませんが
・見た目のキレイさ
（というか先進性というか凄いことやってそうに見せられるというか。。苦笑
・カテゴリカル変数20こ程度
・引き継ぎやデータ更新等を考えて
作図のためのデータハンドリングのコーディングは最少にしたい
・自分自身の興味ｗ
のような趣旨でggplot2でやりたいのです
0613１３２人目の素数さん
2012/09/15(土) 20:06:17.9032bit？64bit？
0614１３２人目の素数さん
2012/09/15(土) 21:09:24.1532bitです
会社の端末なんで詳細は不明ですが
5年くらい前の型で家庭用ＰＣです
Ｒは2.15.0でパッケージは最新です
ggplot2_0.9.2.1
0615１３２人目の素数さん
2012/09/15(土) 22:21:52.64, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
／ ／:::::; -‐''" `ｰノ
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| | | / / ﾚ',二､ﾚ′ ,ｨｲ|ﾞ/ 私は只の数ヲタなんかとは付き合わないわ。
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| l＾,人| ` `-' ゝ | さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
| ` -'＼ ｰ' 人 一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
| /(l ＿＿／ ヽ、 良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
| （:::::`‐-､__ |::::`､ ﾋﾆﾆヽ、 あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
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0616１３２人目の素数さん
2012/09/17(月) 13:49:31.71それでも最後の描画の際にエラーになっちゃうかな？
0617１３２人目の素数さん
2012/09/18(火) 00:00:46.90はい。
ggplot2オブジェクトにそうさをくわえることはできますが、
プロットするさいにメモリオーバーエラーとなってしまいます。
（プロットせずにggsaveしようとしてもおなじです）
0618１３２人目の素数さん
2012/09/18(火) 14:41:03.61じゃあ、データを間引きするしか方法がないのでは？
そもそも100万レコードを視覚化するのに、
そのまま100万レコードが必要なのか？
100万からサンプリングして1万で図を描いても同じ図になる気がするぞ。
0619１３２人目の素数さん
2012/09/18(火) 23:07:04.270620１３２人目の素数さん
2012/09/19(水) 00:02:17.70そういわれるとそうなのです
ただ、問題は>>617なので、なぜそうなるのか分かって、
そこだけ回避できるようになれればよいのですが・・・
0621１３２人目の素数さん
2012/09/19(水) 09:39:21.27例えば散布図なんかだと100万点どころか、1万点ですら多すぎて見づらいから、適切に間引くのが普通だ。
0622１３２人目の素数さん
2012/09/20(木) 10:57:36.08症状から考えて
ggplot2内部的に、
画面表示や画像ファイル保存などの描画時に、
データフレームをSVGみたいな描画用データに変換してから
その描画用データを参照して描画するんだと思う
だから、100万データを扱うことはできても、
グラフ描画（保存も含む）ができない。
しかも、データをどれだけ分割しようと
最終的に描画する際には、
そのグラフに使用する全描画用データを
同時にメモリに保持している必要があるから、
分割が意味をなさない。
だから、どうしても100万データ分使いたいんだったら、
メモリオーバーしない量のデータで一旦画像に保存して、
その画像同士を重ね合わせるみたいな方法をとるしかないかな。
画像処理の手間が必要になりますが。
あるいは、グラフ用のデータを
ダイナミックアロケーションできるような方法が
あるのか知りませんが、なければ作るとか……ｗ
0623１３２人目の素数さん
2012/09/20(木) 16:26:54.47そうだな。>>622の言うとおり、ベクタ構造を保持するからメモリ不足になる。
適当なインターバルでラスタ変換をかませればよろし。
png()で分割出力して、system("convert ...")で重ねる。
0624１３２人目の素数さん
2012/09/20(木) 22:19:32.83>>623
なるほど頭の中が整理されました！
・データの分布を壊さずにデータを間引く関数を作る
・分割描画して最後にラスタデータを統合する関数を作る
・高スペックPCを導入する（）
のどれかって感じですね！
ちょっと試してみるデス
0625625
2012/09/21(金) 00:01:09.500626１３２人目の素数さん
2012/09/26(水) 20:01:39.27任意の行列xを縦に複数回並べたいです。
こんな感じで書いてみたのですが、
forを使わず作れますか、
rep関数だけで実現できないですか？
mat <- NULL
x <- matrix(1:9, 3, 3)
for(i in 1:5){
mat <- rbind(mat,x)
}
mat
0627１３２人目の素数さん
2012/09/26(水) 22:27:54.77>rep関数だけで実現できないですか？
できる
ヒント：
> i <- 5; paste("rbind(", paste(rep("x", i), collapse = ","), ")")
[1] "rbind( x,x,x,x,x )"
0628１３２人目の素数さん
2012/09/26(水) 23:09:49.400629１３２人目の素数さん
2012/09/26(水) 23:40:06.820630１３２人目の素数さん
2012/10/01(月) 04:48:45.78do.call(rbind,lapply(1:5,function(x) matrix(1:9,3)))
5回じゃなくてもっと沢山くっつけるならdo.callのほうが速いみたい
0631１３２人目の素数さん
2012/10/01(月) 23:26:00.72ビッグデータ界隈でR！R！R！騒がしいです。
0632１３２人目の素数さん
2012/10/02(火) 12:27:05.94でも使えておいて損はないと思うよ。
0633１３２人目の素数さん
2012/10/02(火) 15:05:16.56ビッグデータって何GBくらい？
素朴に考えると、Rらしいプログラムの書き方で処理するときには、
データを全てPCのメモリ上に読み込まなければならない。
しかし、オラクルに格納されたデータが、
PC1台のメモリにスッポリ収まるとはとうてい考えられない。
0634１３２人目の素数さん
2012/10/02(火) 19:43:58.58それは時代遅れ。大規模なデータ処理では、データを固定したまま
処理をおこなう処理系自体をデータのあるところに移動しないと間に合わない。
既に昨年、Oracle社はデータはRDBMS上においたまま Rのコードを
実行できる仕組みを提案してるよ。フロントエンドはRで、実行はRDBMSか、
おそらく Exadata という専用ハードの上で行うと思う。
ttps://blogs.oracle.com/dbjp/entry/bigdata_000217
0635１３２人目の素数さん
2012/10/02(火) 20:20:33.97なるほど、オラクルサーバがR（互換）インタプリタを内蔵しているというわけですか。
Rが凄いというよりもORACLEの商魂が凄い。
そういえば、DBMSや統計ソフトのベンダーが
「顧客のニーズを読めてませんでした」とか言ったらギャグになる。
0636１３２人目の素数さん
2012/10/03(水) 20:37:17.21その手の話はOracleに限った話ではない
http://www.revolutionanalytics.com/products/revolution-enterprise-for-ibm-netezza.php
と言うより、Oracle使ってた人がRなんか使うのかね？
そういう人はSASとか使うような気がするが。
0637１３２人目の素数さん
2012/10/03(水) 22:48:32.44うちはOracleとRを使ってる。会社のデータはOracleで管理してるが、
それを可視化したり、対話的に解析するのにRが便利。
両者はODBCデータソース経由でシームレスに繋がる。
確かにSASはいいんだけどライセンス料金が高いので使える人が
限られてしまうが、Rならそういうこと気にせずに済むのがいい。
ただしRはサポートが課題になりやすいけどね。
もしOracleが有償でもRのサポート提供するなら、それを評価する
企業ユーザもいるんじゃないかな？
0638１３２人目の素数さん
2012/10/03(水) 23:16:24.690639１３２人目の素数さん
2012/10/03(水) 23:33:39.40加工してもらうこともできるのかな？
0640１３２人目の素数さん
2012/10/03(水) 23:44:58.20色々考えてみた。
SNS データ量が多い。分析前提でDBが設計してある。データドリブンが前提
銀行 顧客属性、預貯金データ保有、ローン情報
保険 顧客属性、病歴情報保有
クレジットカード 顧客属性、ローン情報、購買データ保有
SNSかクレジットカードだろうか。
0641１３２人目の素数さん
2012/10/03(水) 23:53:37.590642１３２人目の素数さん
2012/10/03(水) 23:56:05.360643１３２人目の素数さん
2012/10/04(木) 00:01:14.410644１３２人目の素数さん
2012/10/04(木) 00:28:41.27SASのライセンス料を気にしてOracleのライセンス料を気にしないのは謎だな
Oracleでまともにビッグデータを扱うと千万円の単位では済まないのに…
0645１３２人目の素数さん
2012/10/04(木) 15:32:50.43PostgreSQL + Rという組み合わせは論外なのかな？
0646１３２人目の素数さん
2012/10/04(木) 20:11:25.61PostgreSQLはBSDライセンスで、RはGPLじゃなかったっけ？
言語処理系部分の流用は出来ないんじゃないの？
0647１３２人目の素数さん
2012/10/04(木) 21:31:10.07Oracle は基幹系の投資に含めやすいし、実際に支払うライセンス料は
年間サポート料やコンサル費に比べれば大した金額じゃないと思う。
むしろコンサル費がべらぼうに高い。
その延長でゆくと、分析ツールはSASでもRでもいいが、こういう分析ツールを
活用できる社員を育成するのに金が掛かるし、企業での課題だと思う。
ちょっと外れてきたね。
0648１３２人目の素数さん
2012/10/04(木) 22:57:30.45それこそ、MapReduceみたいな処理の分散を自分で考えないといけない。
0649１３２人目の素数さん
2012/10/05(金) 00:20:41.39x <- matrix(1:9, 3)
x[rep(1:3,5),]
0650１３２人目の素数さん
2012/10/05(金) 01:07:56.33, '´ _. -‐'''"二ニﾆ=-`ヽ、
／ ／:::::; -‐''" `ｰノ
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| |::/ / / | | || | | ,ﾊ .| ,ﾊ|
| |/ / / /| ,ﾊﾉ| /|ﾉﾚ,ﾆ|ﾙ'
| | | / / ﾚ',二､ﾚ′ ,ｨｲ|ﾞ/ 私は只の数ヲタなんかとは付き合わないわ。
. | ＼ ∠イ ,ｲイ| ,`-' | 頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。
| l＾,人| ` `-' ゝ | さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
| ` -'＼ ｰ' 人 一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
| /(l ＿＿／ ヽ、 良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
| （:::::`‐-､__ |::::`､ ﾋﾆﾆヽ、 あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
| ／ `‐-､::::::::::`‐-､::::＼ /,ﾆﾆ､＼ それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら？
| |::::::::::::::::::|` -､:::::::,ﾍ￣|'､ ﾋﾆ二、 ＼
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| /:::::::::::::::::::/:::::::::::::::::::::::::::::'､::::＼ﾉ ヽ、 |
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0651１３２人目の素数さん
2012/10/08(月) 17:00:48.41もしかしたら、それは旧時代的なビジネスセンスで、SNS出身の人のは新時代のものかもしれないけど。
･･･ないな。
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