もっと顕著に分かるようにしてみた。スレ汚しすまん。
> (a <- factor(sample(1:100, 10)))
[1] 24 42 40 33 66 51 20 100 91 26
Levels: 20 24 26 33 40 42 51 66 91 100
> as.numeric(a)
[1] 2 6 5 4 8 7 1 10 9 3
> as.numeric(as.character(a))
[1] 24 42 40 33 66 51 20 100 91 26
> as.numeric(levels(a))[a]
[1] 24 42 40 33 66 51 20 100 91 26