比率(変化率)の統計を求めるのは、統計学的に
許されるのでしょうか? 

つまり、
値A1,A2・・・An
値B1,B2・・・Bn

があった時、Ai,Bi間の変化率[%] Ci = 100*(Bi-Ai)/Ai が
A,Bと同じくn個あったとき、このCの標準偏差や分散を求める
ということです。