でもどうなんですか?
(1)学部から大学院への飛び級
(2)高校から大学への飛び級
そのいずれも、メジャーな数学科で実施しているところ、あるんでしょうか?

その辺りを見れば、日本数学会の見解として発表されたものが、
学会のマイナーな意見かどうか分かると思います。
ともあれ、評議会とかの手続きを踏んでいないなら問題ですね。